«Биологическая база данных — это большой организованный массив постоянных данных, обычно связанный с компьютеризированным программным обеспечением, предназначенным для обновления, запроса и извлечения компонентов данных, хранящихся в системе. Простая база данных может представлять собой один файл, содержащий множество записей, каждая из которых включает один и тот же набор информации».
Несколько популярных баз данных: GenBank от NCBI (Национальный центр биотехнологической информации), SwissProt от Швейцарского института биоинформатики и PIR от Информационного ресурса о белках.
GenBank: GenBank (банк данных генетических последовательностей) является одним из самых быстрорастущих хранилищ известных генетических последовательностей.
EMBL: База данных нуклеотидных последовательностей EMBL представляет собой обширную базу данных последовательностей ДНК и РНК, собранных из научной литературы и патентных заявок и предоставленных непосредственно исследователями и группами секвенирования.
SwissProt: это база данных последовательностей белков, которая обеспечивает высокий уровень интеграции с другими базами данных, а также имеет очень низкий уровень избыточности (означает, что в базе данных присутствует меньше идентичных последовательностей).
Связанные журналы баз данных биоинформатики
Журнал секвенирования и приложений следующего поколения, транскриптомика: открытый доступ, разработка лекарств: открытый доступ, биоинформатика BMC, брифинги по биоинформатике, брифинги по функциональной геномике и протеомике, сравнительная и функциональная геномика, международный журнал интеллектуального анализа данных и биоинформатики, текущие протоколы в биоинформатике, трансляционная протеомика, Интернет-журнал геномики и протеомики, алгоритмы для молекулярной биологии , Математическая биология и биоинформатика, BMC Bioinformatics