Геномный импринтинг, когда гены одного родителя имеют свойства экспрессии, отличные от свойств экспрессии генов другого родителя, происходит у растений. Это имеет потенциально серьезные последствия из-за важности гибридов в эволюции растений и селекции растений и обеспечивает механизм, который может скрывать генетическую изменчивость на протяжении многих поколений. Изучение организации ядра показывает, что положение хромосомы и генома связано с импринтингом у гибридов F1, при этом периферические геномы склонны экспрессироваться преимущественно. У некоторых инбредных полиплоидных гибридов, таких как тритикале (гибрид пшеницы и ржи), обработка деметилирующим агентом азацитидином высвобождает скрытую вариацию, которая, возможно, была утрачена из-за явления импринтинга.