Молекулярное моделирование включает в себя все стратегии, гипотетические и вычислительные, используемые для моделирования или имитации молекул. Эти методы используются в области вычислительной науки, дизайна лекарств, вычислительной химии и материаловедения, чтобы думать о субатомных структурах, варьирующихся от небольших структурных структур до огромных природных частиц и групп материалов. Регулярным элементом субатомных демонстрационных стратегий является атомистическое изображение субатомных структур. Молекулярное моделирование находит важное применение в разработке новых сильнодействующих лекарств для борьбы с болезнями.