Побочные эффекты пробиотиков, если они возникают, как правило, легкие и связаны с нарушением пищеварения (например, газы или вздутие живота). Пробиотики могут вызывать инфекции, которые необходимо лечить антибиотиками, особенно у людей с сопутствующими заболеваниями.