Кларисса Эрика
Данные секвенирования РНК отдельных клеток могут раскрыть молекулярное разнообразие различных типов клеток. Недавние публикации атласов типов клеток для спинного мозга мышей еще не были объединены. Здесь, используя данные транскриптома отдельных клеток, мы создаем атлас типов спинномозговых клеток, объединяя различные наборы данных в единую систему отсчета. Мы представляем иерархическую структуру постнатальных взаимодействий типов клеток, где местоположение служит высшим уровнем организации, за которым следует статус нейротрансмиттера, семейство и десятки уточненных популяций. Мы картируем географическое распределение каждого типа нейронных клеток в спинном мозге взрослого человека и проверяем комбинаторный код маркера для каждого. Мы также демонстрируем сложные связи между несколькими типами постнатальных клеток. Чтобы помочь в стандартизации идентификации типов клеток, мы также создаем классификатор типов клеток с открытым исходным кодом SeqSeek. Эта работа обеспечивает комплексное понимание различных типов спинномозговых клеток, их молекулярного расположения и профилей экспрессии генов.