Доктор Шукру Тюзмен, профессор Восточно-Средиземноморского университета, Фамагуста.
Классический метод определения функции гена заключается в экспериментальном подавлении его экспрессии с целью изучения полученного фенотипа или влияния на молекулярные конечные точки и сигнальные пути.
Интерференция РНК (РНКi) является одним из недавних открытий естественного механизма регуляции генов, облегчаемого индукцией двухцепочечной РНК в клетку. Синтетические короткие интерферирующие РНК (siRNA) могут быть разработаны для подавления экспрессии определенных генов, несущих определенную целевую последовательность, и потенциально могут быть представлены в качестве терапевтической стратегии для ингибирования транскрипционной регуляции генов, что в таких случаях представляет собой более привлекательную стратегию, чем низкомолекулярные препараты. Коммерчески доступные библиотеки РНКi сделали высокопроизводительный скрининг в масштабе генома осуществимой методологией для изучения сложных систем клеток млекопитающих. Однако крайне важно, чтобы любое наблюдаемое фенотипическое изменение было подтверждено либо на уровне мРНК, либо на уровне белка, чтобы определить валидность целевых генов.
Здесь мы описываем высокопроизводительный скрининг на основе РНК-интерференции, основанный на подходе нокдауна гена, и валидацию ПЦР конкретных уровней транскриптов. Рак ротовой полости чаще всего обнаруживается после того, как он распространился на лимфатические узлы шеи. Раннее обнаружение является ключом к выживанию при раке ротовой полости. В свете таких выгодных применений технология siRNA стала идеальным исследовательским инструментом для изучения функции гена в различных областях исследований и обещает, что использование терапевтических агентов на основе siRNA ускорит открытие лекарств в клинических испытаниях, включая рак ротовой полости.